Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COX10Q12887 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX10Q12887 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX10Q12887 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX10Q12887 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX10Q12887 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX10Q12887 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX10Q12887 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX10Q12887 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX10Q12887 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX10Q12887 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COX10Q12887 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX10Q12887 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX10Q12887 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX10Q12887 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX10Q12887 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX10Q12887 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX10Q12887 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX10Q12887 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX10Q12887 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX10Q12887 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COX10Q12887 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COX10Q12887 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COX10Q12887 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX10Q12887 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX10Q12887 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX10Q12887 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX10Q12887 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COX10Q12887 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COX10Q12887 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
COX10Q12887 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COX10Q12887 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COX10Q12887 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
COX10Q12887 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
COX10Q12887 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
COX10Q12887 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COX10Q12887 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COX10Q12887 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COX10Q12887 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COX10Q12887 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COX10Q12887 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COX10Q12887 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COX10Q12887 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
COX10Q12887 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COX10Q12887 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
COX10Q12887 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
COX10Q12887 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
COX10Q12887 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COX10Q12887 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
COX10Q12887 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
COX10Q12887 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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