Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 YJL144WYJL144W 315 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YJR107WYJR107W 987 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YKL031WYKL031W 414 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 RPL31BYLR406C 342 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 CUE4YML101C 354 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 ELA1YNL230C 1140 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 ATP23YNR020C 813 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 MVD1YNR043W 1191 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 PNG1YPL096W 1092 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 ASR1YPR093C 867 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YBR144CYBR144C 315 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YMR034CYMR034C 1305 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 WTM2YOR229W 1404 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YIL001WYIL001W 1542 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 CMR1YDL156W 1569 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 VTS1YOR359W 1572 nt6.13□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 HAL5YJL165C 2568 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SLX5YDL013W 1860 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 RAD59YDL059C 717 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SLU7YDR088C 1149 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SYF2YGR129W 648 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SOD2YHR008C 702 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 RAD10YML095C 633 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SEC14YMR079W 915 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 LAP2YNL045W 2016 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 UFE1YOR075W 1041 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 DIM1YPL266W 957 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YPR130CYPR130C 408 nt6.12□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 NAF1YNL124W 1479 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 PHO3YBR092C 1404 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 FPR2YDR519W 408 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 RTR1YER139C 681 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YGR115CYGR115C 780 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SRY1YKL218C 981 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YKR032WYKR032W 315 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 CCS1YMR038C 750 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YNR061CYNR061C 660 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YOR111WYOR111W 699 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SER1YOR184W 1188 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YOR289WYOR289W 756 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 DEF1YKL054C 2217 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YPR204WYPR204W 3099 nt6.11□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 NMD5YJR132W 3147 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 GLN3YER040W 2193 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 MLF3YNL074C 1359 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 MTH1YDR277C 1302 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 NUP42YDR192C 1293 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 FCF1YDR339C 570 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 TLG1YDR468C 675 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YIP4YGL198W 708 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 EMC4YGL231C 573 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YGR226CYGR226C 210 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 FMO1YHR176W 1299 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 RPN13YLR421C 471 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YMR085WYMR085W 1299 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 HUT1YPL244C 1020 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 BBP1YPL255W 1158 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YBR287WYBR287W 1284 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 RGT2YDL138W 2292 nt6.1□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SKS1YPL026C 1509 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 HSM3YBR272C 1443 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 AIM17YHL021C 1398 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 PEX3YDR329C 1326 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YDR415CYDR415C 1125 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 RSM28YDR494W 1086 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 PEX18YHR160C 852 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 CAB2YIL083C 1098 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YLR312CYLR312C 1197 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 RIB1YBL033C 1038 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 TOS6YNL300W 309 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YNR005CYNR005C 405 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 HTZ1YOL012C 405 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 YOR238WYOR238W 912 nt6.09□□□□□ -1.43
TY1A-NL1Q12391 SPS2YDR522C 1509 nt6.09□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SEC12YNR026C 1416 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 VPS72YDR485C 2388 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SNM1YDR478W 597 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 TAN1YGL232W 870 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt6.08□□□□□ -1.44
TY1A-NL1Q12391 SEN15YMR059W 387 nt6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms