Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CPSF1Q10570 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.64
CPSF1Q10570 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CPSF1Q10570 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms