Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RIPPLY1Q0D2K3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RIPPLY1Q0D2K3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms