Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SPOCK1Q08629 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SPOCK1Q08629 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms