Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PDE4DQ08499 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PDE4DQ08499 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PDE4DQ08499 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms