Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE4CQ08493 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PDE4CQ08493 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PDE4CQ08493 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms