Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB2Q08289 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CACNB2Q08289 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CACNB2Q08289 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms