Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SRSF4Q08170 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SRSF4Q08170 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms