Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CXCL9Q07325 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CXCL9Q07325 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CXCL9Q07325 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CXCL9Q07325 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CXCL9Q07325 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms