Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FMODQ06828 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FMODQ06828 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FMODQ06828 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FMODQ06828 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FMODQ06828 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FMODQ06828 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FMODQ06828 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FMODQ06828 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FMODQ06828 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FMODQ06828 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FMODQ06828 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FMODQ06828 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FMODQ06828 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FMODQ06828 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FMODQ06828 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FMODQ06828 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FMODQ06828 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
FMODQ06828 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FMODQ06828 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FMODQ06828 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FMODQ06828 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
FMODQ06828 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
FMODQ06828 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FMODQ06828 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
FMODQ06828 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FMODQ06828 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FMODQ06828 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FMODQ06828 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FMODQ06828 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FMODQ06828 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FMODQ06828 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FMODQ06828 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
FMODQ06828 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
FMODQ06828 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FMODQ06828 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FMODQ06828 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FMODQ06828 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FMODQ06828 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FMODQ06828 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FMODQ06828 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
FMODQ06828 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
FMODQ06828 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FMODQ06828 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FMODQ06828 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FMODQ06828 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FMODQ06828 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FMODQ06828 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FMODQ06828 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FMODQ06828 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FMODQ06828 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
FMODQ06828 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
FMODQ06828 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FMODQ06828 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FMODQ06828 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FMODQ06828 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FMODQ06828 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms