Protein–RNA interactions for Protein: Q06587

RING1, E3 ubiquitin-protein ligase RING1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RING1Q06587 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RING1Q06587 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RING1Q06587 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RING1Q06587 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RING1Q06587 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RING1Q06587 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RING1Q06587 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RING1Q06587 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RING1Q06587 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RING1Q06587 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RING1Q06587 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RING1Q06587 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RING1Q06587 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RING1Q06587 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RING1Q06587 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RING1Q06587 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RING1Q06587 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RING1Q06587 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RING1Q06587 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RING1Q06587 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RING1Q06587 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RING1Q06587 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RING1Q06587 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RING1Q06587 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RING1Q06587 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RING1Q06587 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RING1Q06587 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RING1Q06587 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RING1Q06587 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RING1Q06587 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RING1Q06587 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RING1Q06587 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RING1Q06587 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RING1Q06587 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RING1Q06587 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RING1Q06587 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RING1Q06587 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RING1Q06587 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RING1Q06587 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RING1Q06587 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RING1Q06587 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RING1Q06587 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RING1Q06587 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RING1Q06587 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RING1Q06587 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RING1Q06587 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RING1Q06587 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RING1Q06587 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RING1Q06587 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RING1Q06587 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RING1Q06587 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RING1Q06587 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RING1Q06587 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RING1Q06587 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RING1Q06587 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RING1Q06587 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RING1Q06587 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RING1Q06587 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RING1Q06587 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RING1Q06587 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RING1Q06587 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RING1Q06587 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RING1Q06587 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RING1Q06587 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RING1Q06587 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RING1Q06587 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RING1Q06587 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RING1Q06587 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RING1Q06587 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RING1Q06587 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RING1Q06587 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RING1Q06587 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RING1Q06587 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RING1Q06587 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RING1Q06587 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RING1Q06587 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RING1Q06587 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms