Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EMX1Q04741 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
EMX1Q04741 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms