Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DSG1Q02413 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DSG1Q02413 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DSG1Q02413 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms