Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC6A3Q01959 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC6A3Q01959 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC6A3Q01959 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms