Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
IFITM3Q01628 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
IFITM3Q01628 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms