Protein–RNA interactions for Protein: Q01453

PMP22, Peripheral myelin protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMP22Q01453 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PMP22Q01453 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PMP22Q01453 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PMP22Q01453 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms