Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MS4A2Q01362 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms