Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
E2F1Q01094 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F1Q01094 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F1Q01094 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms