Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MDM2Q00987 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MDM2Q00987 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MDM2Q00987 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MDM2Q00987 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MDM2Q00987 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MDM2Q00987 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MDM2Q00987 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms