Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDC42EP1Q00587 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDC42EP1Q00587 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms