Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
HOXC5Q00444 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXC5Q00444 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXC5Q00444 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms