Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIM1P81133 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIM1P81133 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIM1P81133 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIM1P81133 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIM1P81133 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIM1P81133 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIM1P81133 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SIM1P81133 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIM1P81133 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIM1P81133 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIM1P81133 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SIM1P81133 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIM1P81133 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIM1P81133 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIM1P81133 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIM1P81133 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SIM1P81133 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIM1P81133 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIM1P81133 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIM1P81133 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIM1P81133 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIM1P81133 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SIM1P81133 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIM1P81133 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SIM1P81133 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIM1P81133 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIM1P81133 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIM1P81133 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIM1P81133 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIM1P81133 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIM1P81133 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIM1P81133 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIM1P81133 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIM1P81133 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIM1P81133 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIM1P81133 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIM1P81133 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIM1P81133 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIM1P81133 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIM1P81133 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIM1P81133 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIM1P81133 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIM1P81133 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SIM1P81133 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIM1P81133 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIM1P81133 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIM1P81133 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIM1P81133 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIM1P81133 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIM1P81133 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIM1P81133 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIM1P81133 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIM1P81133 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIM1P81133 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIM1P81133 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SIM1P81133 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIM1P81133 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIM1P81133 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIM1P81133 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIM1P81133 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIM1P81133 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIM1P81133 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIM1P81133 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIM1P81133 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIM1P81133 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIM1P81133 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIM1P81133 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SIM1P81133 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIM1P81133 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIM1P81133 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIM1P81133 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIM1P81133 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIM1P81133 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SIM1P81133 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIM1P81133 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIM1P81133 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIM1P81133 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIM1P81133 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIM1P81133 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIM1P81133 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIM1P81133 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIM1P81133 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SIM1P81133 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIM1P81133 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIM1P81133 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIM1P81133 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIM1P81133 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SIM1P81133 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIM1P81133 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIM1P81133 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIM1P81133 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIM1P81133 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIM1P81133 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIM1P81133 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIM1P81133 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIM1P81133 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIM1P81133 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIM1P81133 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIM1P81133 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms