Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX3P78415 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX3P78415 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX3P78415 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX3P78415 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
IRX3P78415 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
IRX3P78415 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRX3P78415 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRX3P78415 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRX3P78415 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRX3P78415 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRX3P78415 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRX3P78415 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
IRX3P78415 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRX3P78415 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRX3P78415 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRX3P78415 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRX3P78415 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRX3P78415 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IRX3P78415 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
IRX3P78415 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX3P78415 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX3P78415 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX3P78415 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX3P78415 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX3P78415 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX3P78415 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX3P78415 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX3P78415 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX3P78415 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
IRX3P78415 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
IRX3P78415 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRX3P78415 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRX3P78415 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRX3P78415 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
IRX3P78415 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRX3P78415 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
IRX3P78415 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRX3P78415 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRX3P78415 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRX3P78415 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
IRX3P78415 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX3P78415 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX3P78415 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX3P78415 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX3P78415 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX3P78415 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX3P78415 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
IRX3P78415 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX3P78415 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX3P78415 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX3P78415 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX3P78415 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX3P78415 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX3P78415 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX3P78415 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX3P78415 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
IRX3P78415 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX3P78415 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX3P78415 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX3P78415 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX3P78415 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
IRX3P78415 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX3P78415 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX3P78415 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX3P78415 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX3P78415 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX3P78415 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX3P78415 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
IRX3P78415 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX3P78415 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX3P78415 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX3P78415 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX3P78415 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX3P78415 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
IRX3P78415 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX3P78415 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX3P78415 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX3P78415 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX3P78415 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX3P78415 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX3P78415 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX3P78415 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX3P78415 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
IRX3P78415 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX3P78415 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX3P78415 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
IRX3P78415 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms