Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNNC1P63316 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TNNC1P63316 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TNNC1P63316 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms