Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUMO1P63165 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO1P63165 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO1P63165 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms