Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNRPD1P62314 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPD1P62314 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPD1P62314 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms