Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNRPFP62306 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SNRPFP62306 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms