Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COPZ1P61923 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COPZ1P61923 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ1P61923 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ1P61923 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ1P61923 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ1P61923 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COPZ1P61923 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ1P61923 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ1P61923 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COPZ1P61923 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPZ1P61923 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPZ1P61923 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPZ1P61923 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPZ1P61923 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COPZ1P61923 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COPZ1P61923 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COPZ1P61923 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPZ1P61923 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COPZ1P61923 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPZ1P61923 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.28■■□□□ 1
COPZ1P61923 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
COPZ1P61923 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COPZ1P61923 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPZ1P61923 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPZ1P61923 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COPZ1P61923 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPZ1P61923 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPZ1P61923 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPZ1P61923 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPZ1P61923 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COPZ1P61923 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COPZ1P61923 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COPZ1P61923 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
COPZ1P61923 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
COPZ1P61923 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms