Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VBP1P61758 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VBP1P61758 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VBP1P61758 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VBP1P61758 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VBP1P61758 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
VBP1P61758 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VBP1P61758 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VBP1P61758 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VBP1P61758 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VBP1P61758 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VBP1P61758 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VBP1P61758 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
VBP1P61758 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
VBP1P61758 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VBP1P61758 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VBP1P61758 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
VBP1P61758 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
VBP1P61758 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VBP1P61758 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
VBP1P61758 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
VBP1P61758 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VBP1P61758 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VBP1P61758 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VBP1P61758 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
VBP1P61758 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
VBP1P61758 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VBP1P61758 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VBP1P61758 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VBP1P61758 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VBP1P61758 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VBP1P61758 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VBP1P61758 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VBP1P61758 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
VBP1P61758 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
VBP1P61758 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
VBP1P61758 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VBP1P61758 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VBP1P61758 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VBP1P61758 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VBP1P61758 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VBP1P61758 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
VBP1P61758 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
VBP1P61758 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VBP1P61758 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VBP1P61758 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
VBP1P61758 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VBP1P61758 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VBP1P61758 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VBP1P61758 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VBP1P61758 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VBP1P61758 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VBP1P61758 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VBP1P61758 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms