Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HERVK_113P61574 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HERVK_113P61574 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms