Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STX1BP61266 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX1BP61266 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX1BP61266 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX1BP61266 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX1BP61266 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX1BP61266 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX1BP61266 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX1BP61266 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX1BP61266 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX1BP61266 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX1BP61266 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STX1BP61266 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
STX1BP61266 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
STX1BP61266 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
STX1BP61266 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX1BP61266 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX1BP61266 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX1BP61266 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX1BP61266 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX1BP61266 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX1BP61266 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX1BP61266 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX1BP61266 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STX1BP61266 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STX1BP61266 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX1BP61266 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX1BP61266 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX1BP61266 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX1BP61266 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX1BP61266 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX1BP61266 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX1BP61266 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STX1BP61266 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX1BP61266 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX1BP61266 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX1BP61266 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX1BP61266 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX1BP61266 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX1BP61266 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX1BP61266 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX1BP61266 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STX1BP61266 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STX1BP61266 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STX1BP61266 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX1BP61266 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX1BP61266 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
STX1BP61266 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX1BP61266 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX1BP61266 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
STX1BP61266 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX1BP61266 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STX1BP61266 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms