Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM258P61165 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM258P61165 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM258P61165 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM258P61165 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM258P61165 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM258P61165 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM258P61165 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM258P61165 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM258P61165 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM258P61165 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TMEM258P61165 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TMEM258P61165 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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TMEM258P61165 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TMEM258P61165 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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TMEM258P61165 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TMEM258P61165 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TMEM258P61165 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TMEM258P61165 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TMEM258P61165 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TMEM258P61165 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TMEM258P61165 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TMEM258P61165 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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TMEM258P61165 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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