Protein–RNA interactions for Protein: P61158

ACTR3, Actin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3P61158 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTR3P61158 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTR3P61158 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms