Protein–RNA interactions for Protein: P60510

PPP4C, Serine/threonine-protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4CP60510 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4CP60510 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4CP60510 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PPP4CP60510 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4CP60510 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4CP60510 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4CP60510 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PPP4CP60510 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4CP60510 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4CP60510 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4CP60510 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4CP60510 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPP4CP60510 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PPP4CP60510 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPP4CP60510 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPP4CP60510 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP4CP60510 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPP4CP60510 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP4CP60510 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP4CP60510 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP4CP60510 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP4CP60510 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP4CP60510 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP4CP60510 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPP4CP60510 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms