Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FAM3BP58499 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FAM3BP58499 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FAM3BP58499 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3BP58499 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3BP58499 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FAM3BP58499 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms