Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX16P57768 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX16P57768 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX16P57768 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX16P57768 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX16P57768 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX16P57768 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX16P57768 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX16P57768 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX16P57768 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX16P57768 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX16P57768 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX16P57768 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX16P57768 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX16P57768 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX16P57768 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX16P57768 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX16P57768 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX16P57768 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX16P57768 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX16P57768 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX16P57768 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX16P57768 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX16P57768 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX16P57768 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX16P57768 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX16P57768 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX16P57768 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX16P57768 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX16P57768 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX16P57768 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX16P57768 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX16P57768 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX16P57768 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX16P57768 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX16P57768 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX16P57768 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX16P57768 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX16P57768 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX16P57768 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX16P57768 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX16P57768 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX16P57768 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX16P57768 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX16P57768 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX16P57768 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX16P57768 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX16P57768 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX16P57768 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX16P57768 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX16P57768 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX16P57768 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX16P57768 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX16P57768 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX16P57768 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX16P57768 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX16P57768 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX16P57768 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX16P57768 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX16P57768 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX16P57768 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX16P57768 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX16P57768 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX16P57768 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX16P57768 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX16P57768 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SNX16P57768 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX16P57768 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX16P57768 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX16P57768 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX16P57768 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX16P57768 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX16P57768 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX16P57768 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX16P57768 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX16P57768 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms