Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN8P56748 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN8P56748 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms