Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RP1P56715 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RP1P56715 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP1P56715 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP1P56715 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP1P56715 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP1P56715 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP1P56715 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP1P56715 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RP1P56715 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP1P56715 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP1P56715 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP1P56715 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP1P56715 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RP1P56715 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RP1P56715 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP1P56715 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP1P56715 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RP1P56715 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP1P56715 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP1P56715 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP1P56715 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP1P56715 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP1P56715 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP1P56715 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP1P56715 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP1P56715 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RP1P56715 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP1P56715 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RP1P56715 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP1P56715 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RP1P56715 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RP1P56715 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RP1P56715 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RP1P56715 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RP1P56715 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP1P56715 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP1P56715 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP1P56715 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP1P56715 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP1P56715 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP1P56715 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP1P56715 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP1P56715 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP1P56715 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP1P56715 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP1P56715 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP1P56715 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP1P56715 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP1P56715 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP1P56715 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP1P56715 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP1P56715 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP1P56715 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms