Protein–RNA interactions for Protein: P56182

RRP1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1P56182 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP1P56182 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP1P56182 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP1P56182 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RRP1P56182 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRP1P56182 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRP1P56182 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRP1P56182 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRP1P56182 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RRP1P56182 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1P56182 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1P56182 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1P56182 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1P56182 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1P56182 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1P56182 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1P56182 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1P56182 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RRP1P56182 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1P56182 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1P56182 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1P56182 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1P56182 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1P56182 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1P56182 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1P56182 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1P56182 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1P56182 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RRP1P56182 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP1P56182 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP1P56182 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP1P56182 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP1P56182 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RRP1P56182 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1P56182 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1P56182 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1P56182 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1P56182 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1P56182 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1P56182 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1P56182 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RRP1P56182 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RRP1P56182 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1P56182 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1P56182 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1P56182 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1P56182 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1P56182 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1P56182 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1P56182 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1P56182 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RRP1P56182 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP1P56182 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP1P56182 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP1P56182 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP1P56182 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP1P56182 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP1P56182 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP1P56182 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1P56182 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1P56182 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1P56182 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1P56182 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1P56182 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1P56182 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1P56182 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1P56182 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RRP1P56182 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP1P56182 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP1P56182 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP1P56182 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP1P56182 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP1P56182 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP1P56182 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP1P56182 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP1P56182 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP1P56182 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP1P56182 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP1P56182 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP1P56182 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP1P56182 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP1P56182 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP1P56182 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP1P56182 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP1P56182 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP1P56182 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP1P56182 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms