Protein–RNA interactions for Protein: P55289

CDH12, Cadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH12P55289 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH12P55289 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH12P55289 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH12P55289 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH12P55289 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH12P55289 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH12P55289 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CDH12P55289 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH12P55289 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH12P55289 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH12P55289 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH12P55289 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH12P55289 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH12P55289 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH12P55289 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH12P55289 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH12P55289 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CDH12P55289 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH12P55289 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH12P55289 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH12P55289 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDH12P55289 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH12P55289 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH12P55289 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH12P55289 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH12P55289 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH12P55289 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CDH12P55289 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH12P55289 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDH12P55289 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH12P55289 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH12P55289 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDH12P55289 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH12P55289 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH12P55289 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH12P55289 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH12P55289 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH12P55289 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH12P55289 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH12P55289 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDH12P55289 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDH12P55289 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDH12P55289 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH12P55289 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH12P55289 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CDH12P55289 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH12P55289 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH12P55289 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH12P55289 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH12P55289 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH12P55289 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH12P55289 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH12P55289 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH12P55289 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH12P55289 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDH12P55289 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH12P55289 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH12P55289 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH12P55289 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH12P55289 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH12P55289 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH12P55289 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH12P55289 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH12P55289 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDH12P55289 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH12P55289 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDH12P55289 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms