Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASP7P55210 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP7P55210 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP7P55210 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP7P55210 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP7P55210 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP7P55210 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP7P55210 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP7P55210 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASP7P55210 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP7P55210 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP7P55210 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP7P55210 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP7P55210 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP7P55210 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP7P55210 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP7P55210 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASP7P55210 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP7P55210 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP7P55210 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP7P55210 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP7P55210 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASP7P55210 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP7P55210 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP7P55210 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP7P55210 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP7P55210 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP7P55210 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASP7P55210 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP7P55210 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP7P55210 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP7P55210 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP7P55210 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP7P55210 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP7P55210 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP7P55210 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP7P55210 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASP7P55210 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP7P55210 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP7P55210 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP7P55210 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP7P55210 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP7P55210 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASP7P55210 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP7P55210 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP7P55210 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP7P55210 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP7P55210 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP7P55210 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP7P55210 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP7P55210 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CASP7P55210 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP7P55210 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP7P55210 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP7P55210 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP7P55210 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP7P55210 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP7P55210 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP7P55210 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP7P55210 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASP7P55210 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CASP7P55210 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CASP7P55210 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASP7P55210 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CASP7P55210 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CASP7P55210 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASP7P55210 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CASP7P55210 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASP7P55210 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CASP7P55210 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP7P55210 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP7P55210 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP7P55210 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASP7P55210 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CASP7P55210 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASP7P55210 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASP7P55210 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASP7P55210 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP7P55210 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP7P55210 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP7P55210 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP7P55210 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP7P55210 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP7P55210 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASP7P55210 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP7P55210 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP7P55210 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP7P55210 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASP7P55210 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms