Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP12AP54707 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP12AP54707 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP12AP54707 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP12AP54707 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP12AP54707 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP12AP54707 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP12AP54707 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP12AP54707 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP12AP54707 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP12AP54707 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP12AP54707 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP12AP54707 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP12AP54707 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP12AP54707 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP12AP54707 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP12AP54707 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP12AP54707 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP12AP54707 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP12AP54707 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP12AP54707 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP12AP54707 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP12AP54707 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP12AP54707 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP12AP54707 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP12AP54707 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP12AP54707 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP12AP54707 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP12AP54707 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP12AP54707 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP12AP54707 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP12AP54707 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP12AP54707 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP12AP54707 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP12AP54707 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP12AP54707 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP12AP54707 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP12AP54707 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP12AP54707 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP12AP54707 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP12AP54707 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP12AP54707 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP12AP54707 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms