Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATN1P54259 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATN1P54259 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATN1P54259 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATN1P54259 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATN1P54259 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATN1P54259 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATN1P54259 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATN1P54259 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATN1P54259 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATN1P54259 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATN1P54259 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATN1P54259 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATN1P54259 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATN1P54259 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATN1P54259 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATN1P54259 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATN1P54259 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATN1P54259 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATN1P54259 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATN1P54259 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATN1P54259 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ATN1P54259 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATN1P54259 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATN1P54259 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATN1P54259 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATN1P54259 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATN1P54259 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATN1P54259 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATN1P54259 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATN1P54259 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATN1P54259 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATN1P54259 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATN1P54259 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATN1P54259 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATN1P54259 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATN1P54259 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATN1P54259 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATN1P54259 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ATN1P54259 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATN1P54259 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATN1P54259 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATN1P54259 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATN1P54259 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATN1P54259 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATN1P54259 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATN1P54259 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATN1P54259 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATN1P54259 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATN1P54259 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATN1P54259 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATN1P54259 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATN1P54259 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATN1P54259 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATN1P54259 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATN1P54259 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATN1P54259 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATN1P54259 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATN1P54259 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATN1P54259 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATN1P54259 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms