Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CLNS1AP54105 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CLNS1AP54105 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms