Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMTNP53814 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMTNP53814 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SMTNP53814 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SMTNP53814 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNP53814 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNP53814 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNP53814 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNP53814 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNP53814 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNP53814 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNP53814 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNP53814 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SMTNP53814 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNP53814 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNP53814 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNP53814 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNP53814 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNP53814 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNP53814 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNP53814 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNP53814 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNP53814 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNP53814 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SMTNP53814 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNP53814 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNP53814 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNP53814 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNP53814 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNP53814 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNP53814 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNP53814 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNP53814 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SMTNP53814 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMTNP53814 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMTNP53814 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMTNP53814 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SMTNP53814 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNP53814 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNP53814 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNP53814 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNP53814 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNP53814 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNP53814 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNP53814 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNP53814 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNP53814 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNP53814 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SMTNP53814 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNP53814 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNP53814 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNP53814 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNP53814 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNP53814 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNP53814 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNP53814 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNP53814 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNP53814 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNP53814 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SMTNP53814 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNP53814 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNP53814 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNP53814 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNP53814 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNP53814 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNP53814 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNP53814 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNP53814 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNP53814 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNP53814 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SMTNP53814 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SMTNP53814 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNP53814 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNP53814 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNP53814 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNP53814 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms