Protein–RNA interactions for Protein: P53634

CTSC, Dipeptidyl peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSCP53634 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSCP53634 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTSCP53634 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSCP53634 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSCP53634 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSCP53634 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSCP53634 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSCP53634 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSCP53634 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSCP53634 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSCP53634 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSCP53634 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSCP53634 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTSCP53634 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTSCP53634 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSCP53634 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSCP53634 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSCP53634 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSCP53634 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSCP53634 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSCP53634 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSCP53634 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSCP53634 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTSCP53634 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSCP53634 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSCP53634 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSCP53634 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSCP53634 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSCP53634 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSCP53634 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSCP53634 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSCP53634 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSCP53634 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTSCP53634 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTSCP53634 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTSCP53634 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTSCP53634 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSCP53634 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSCP53634 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSCP53634 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSCP53634 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSCP53634 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSCP53634 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSCP53634 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSCP53634 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CTSCP53634 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSCP53634 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSCP53634 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSCP53634 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSCP53634 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSCP53634 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSCP53634 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CTSCP53634 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSCP53634 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSCP53634 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSCP53634 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSCP53634 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CTSCP53634 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSCP53634 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSCP53634 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSCP53634 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSCP53634 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CTSCP53634 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CTSCP53634 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms