Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK2P51955 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK2P51955 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK2P51955 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK2P51955 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NEK2P51955 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK2P51955 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK2P51955 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK2P51955 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK2P51955 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK2P51955 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NEK2P51955 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK2P51955 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK2P51955 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK2P51955 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK2P51955 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK2P51955 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK2P51955 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK2P51955 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK2P51955 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK2P51955 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK2P51955 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK2P51955 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK2P51955 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK2P51955 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK2P51955 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK2P51955 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK2P51955 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NEK2P51955 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK2P51955 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK2P51955 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK2P51955 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK2P51955 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK2P51955 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK2P51955 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK2P51955 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK2P51955 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK2P51955 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK2P51955 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK2P51955 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK2P51955 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK2P51955 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK2P51955 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK2P51955 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK2P51955 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK2P51955 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK2P51955 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEK2P51955 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms