Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLCN3P51790 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLCN3P51790 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms