Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR5P51681 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR5P51681 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR5P51681 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR5P51681 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR5P51681 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR5P51681 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR5P51681 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR5P51681 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR5P51681 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR5P51681 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR5P51681 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR5P51681 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR5P51681 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR5P51681 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR5P51681 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR5P51681 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR5P51681 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR5P51681 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR5P51681 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR5P51681 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR5P51681 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR5P51681 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR5P51681 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR5P51681 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR5P51681 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR5P51681 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR5P51681 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR5P51681 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR5P51681 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR5P51681 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR5P51681 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR5P51681 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR5P51681 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR5P51681 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR5P51681 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR5P51681 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR5P51681 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR5P51681 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR5P51681 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR5P51681 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR5P51681 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR5P51681 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR5P51681 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR5P51681 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR5P51681 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR5P51681 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR5P51681 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR5P51681 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR5P51681 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR5P51681 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR5P51681 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR5P51681 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR5P51681 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR5P51681 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR5P51681 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR5P51681 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR5P51681 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR5P51681 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR5P51681 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR5P51681 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR5P51681 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR5P51681 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR5P51681 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR5P51681 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR5P51681 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR5P51681 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR5P51681 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR5P51681 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR5P51681 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR5P51681 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR5P51681 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR5P51681 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR5P51681 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR5P51681 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR5P51681 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR5P51681 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR5P51681 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms